MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-2

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016034	GTTGAA	2	12	4	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825836
2	NC_016034	A	7	7	19	25	100 %	0 %	0 %	0 %	347825836
3	NC_016034	T	6	6	111	116	0 %	100 %	0 %	0 %	347825836
4	NC_016034	A	7	7	158	164	100 %	0 %	0 %	0 %	347825836
5	NC_016034	AAAAC	2	10	270	279	80 %	0 %	0 %	20 %	347825837
6	NC_016034	A	6	6	416	421	100 %	0 %	0 %	0 %	347825837
7	NC_016034	GAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347825837
8	NC_016034	ATT	2	6	730	735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825837
9	NC_016034	AG	3	6	779	784	50 %	0 %	50 %	0 %	347825837
10	NC_016034	TTA	2	6	796	801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825837
11	NC_016034	AT	3	6	806	811	50 %	50 %	0 %	0 %	347825837
12	NC_016034	A	6	6	857	862	100 %	0 %	0 %	0 %	347825837
13	NC_016034	A	6	6	891	896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016034	GA	3	6	897	902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016034	GATTTT	2	12	917	928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016034	TAA	2	6	929	934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016034	ATT	2	6	960	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016034	T	7	7	964	970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016034	TATGC	2	10	1058	1067	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016034	GTG	2	6	1097	1102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016034	AGCG	2	8	1310	1317	25 %	0 %	50 %	25 %	347825838
22	NC_016034	AATG	2	8	1342	1349	50 %	25 %	25 %	0 %	347825838
23	NC_016034	ATT	2	6	1351	1356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825838
24	NC_016034	CGG	2	6	1388	1393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347825838
25	NC_016034	GAA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347825838
26	NC_016034	GAA	2	6	1450	1455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347825838
27	NC_016034	TGA	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825838
28	NC_016034	CA	3	6	1496	1501	50 %	0 %	0 %	50 %	347825838
29	NC_016034	TGA	3	9	1524	1532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825838
30	NC_016034	GCA	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347825838
31	NC_016034	AGC	2	6	1722	1727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347825838
32	NC_016034	AGC	2	6	1745	1750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347825838
33	NC_016034	TTTTGA	2	12	1851	1862	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347825838
34	NC_016034	TCG	2	6	1995	2000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347825838
35	NC_016034	CTT	2	6	2052	2057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347825838
36	NC_016034	GGTT	2	8	2073	2080	0 %	50 %	50 %	0 %	347825838
37	NC_016034	AGTG	2	8	2086	2093	25 %	25 %	50 %	0 %	347825838
38	NC_016034	A	6	6	2125	2130	100 %	0 %	0 %	0 %	347825838
39	NC_016034	ATG	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825838
40	NC_016034	TTTAA	2	10	2211	2220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016034	TGA	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016034	GTCA	2	8	2253	2260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016034	TTGA	2	8	2326	2333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016034	T	7	7	2382	2388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016034	GAGT	2	8	2409	2416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016034	A	6	6	2496	2501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016034	GAA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016034	C	6	6	2540	2545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_016034	TAT	2	6	2572	2577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016034	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016034	TAA	2	6	2595	2600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016034	T	6	6	2615	2620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016034	ATT	2	6	2633	2638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016034	GTAT	2	8	2650	2657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016034	ATG	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016034	AAG	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.